 
|
|
|
|
Cieľom tohto tutoriálu je objasniť základnú prácu s programom COPASI. Ukážeme si ako vložiť katalyzovanú reakciu.
Spustíme si simuláciu a vykreslíme graf koncentrácií v čase.
|
|
1.
|
Prevezmite si program COPASI (v 4.5) z http://www.copasi.org/
|
|
|
2.
|
COPASI nainštalujte
|
|
|
3.
|
Spustite
|
|
|
4.
|
Pre reakciu
definujeme globálne konštanty k v záložke Model->Biochemical->Global
Quantities
|
|
|
5.
|
Zadáme 3 čiastkové reakcie:
r1 ako A -> B (k1)
r2 ako B -> C + D (k2)
r3 ako C + D -> B (k3)
|
|
|
6.
|
V záložke Tasks->Time course nastavíme Duration a
Interval Size
|
|
|
7.
|
Kliknutím na Output Assistant nastavte graf Concentrations, Volumes, and Global
Quantity Values
|
|
|
8.
|
Kliknutím na Run prebehne výpočet a vykreslí sa graf
|
|
|
COPASI súbor s daným príkladom si môžete stiahnuť (copasi-tutorial.cps).
|